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1.內(nèi)源性過氧化酶的普遍存在，如人腦安排中，呼吸道分泌物的炎癥細胞中及某些病毒的安排培養(yǎng)中均有內(nèi)源性過氧化物酶的生機，常不易除掉，如果用某些辦法除掉時，則病毒的抗原性亦受到破壞，對于用ELISA檢測晦氣。
2.對ELISA法的非特異性評估的材料尚不夠完善，因而，對呈現(xiàn)一些非特異性反應(yīng)的時分，往往不易解說。
3.因為ELISA所用的抗原大部分仍是混合的可溶性抗原，所以對同一微生物寄生蟲或其他物質(zhì)不同部位的抗原還沒有分隔。
4.固相載體的質(zhì)量常不共同，主要是原料及制備工藝還不共同，致使不同批號的固相載體有時本底值較高，有時吸附功能很差，影響實驗成果。
5.試劑不共同，現(xiàn)在處于“八仙過海，各顯神通"，標準還不能共同。

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